孔庙国子监既彼此邻，又各院落。孔庙的殿，国子监的辟雍彝伦堂，是其典型的、精的历史文化殿堂。
孔庙是祭祀儒派创始人、思教育孔子的庙堂。早在吉思汗兵初，攻城略，掳掠焚杀，耶律楚材向蒙古汗谏言，尊儒，被采纳，尊儒国。孔庙建元德十年（1306年），经明、清改建重建，现在的格局，占22000平方米，建筑面积7400平方米，院内苍松翠柏，古树参。触奸柏：今孔庙有古树108棵，国子监有古树43棵，其中孔庙内最的一棵柏树，相传是元代国子监祭酒许衡手植，近七百年树龄，繁枝盘错，挺拔苍翠。传说明朝严嵩代嘉靖帝祭孔，行至树，树枝揭掉了他的乌纱帽。几年又长了一树瘤，横似一龙爪抓住了一人头。人便认柏树有知，够辨别忠奸，因此称“触奸柏”或“辨奸柏”。
殿孔庙中轴线有三进院。门（先师门）内一进院，东西有碑亭等，院内布列进士题名碑。门内二进院，主体建筑殿，面阔9间，进深5间，建在2.24米高的露台，露台三陛，四周有石护栏。殿通高33米，殿内有孔子塑像、神位，悬康熙帝御书“万世师表”匾。殿前东西庑称，各19间，长80米，宽13米，面积1040平方米。中国书店1961年4月1964年4月，将专服务部及部分内柜书迁孔庙东庑营业，那我常书，中午带窝窝头，书店先生极热情，供应水。有其西院国子监的首图书馆善本部书。孔庙的书，全部架，阅读方便，获益良，至今铭记。从祀先贤先儒156人。崇圣门内三进院，有祭祀孔子先人的崇圣祠5间，覆绿琉璃瓦。雍正五年（1727年）二月初七日谕：“定八月二十七日，先师诞辰，官民军士，致斋一日，常。”（《清史稿·礼志三》卷八十四）是清代的“孔子节”。孔庙是中华传统文化的象征，体现中华儒文化魂。砚水湖：北京孔庙中的一眼古井，因坐落在德胜门至安定门内带的水线，井水常溢井口，水清澈甘冽。相传进京科考举子在孔庙拜谒，饮井中“圣水”，便文思泉涌，笔生花。井水磨墨，浓墨喷香，落笔神。清乾隆帝特赐其名“砚水湖”。
清朝孔庙做了重礼制提升举措：
其一，称谓。“至圣先师孔子”，孔子由“文宣王”，被尊“继尧舜禹唐文武”的“至圣先师”。
其二，殿瓦。殿原是灰瓦，明万历二十八年（1600年）诏换绿琉璃瓦。清乾隆二年（1737年），命孔庙“门、殿，著黄瓦”。（《清高宗实录》卷五十）
其三，殿顶。殿的殿顶，最高建筑等级的庑殿顶。与皇宫的太殿、奉先殿、皇极殿同庑殿顶。其枋额，玺彩画。曲阜孔庙的殿，黄琉璃瓦庑殿顶。
其四，祀。孔子“德配，万世师表”，著由中祀，升祀。（《清德宗实录》卷五百六十六）祭孔子的文庙，同祭、、宗、社等并列祀。
在国内，山东曲阜的孔庙，则是孔子的庙。各府州县有孔庙（今存约509座）。在台湾，清台湾府（今台南市）建有孔庙。今台北市孔庙保护完，殿内高悬康熙帝御书“万世师表”匾。
在国外，越南、日本、韩国有孔庙。越南河内孔庙（文庙），有900年历史，占24500平方米，内有进士题名碑82通，镌刻1306名进士的姓名籍贯。日本东京的孔庙曾是国文庙，今足利孔庙仍供奉木雕孔子坐像，今长崎孔庙巍屹立。韩国均馆是“前（文）庙（太）”的布局，有与中国孔庙同名的殿等建筑。
国子监明永乐迁北京，在北京设国子监。明朝国子监有两处，在南京的叫南监，在北京的叫北监。监的正堂明伦堂（彝伦堂）。国子监的贡生、监生分别在率、修、诚、正义、崇志、广业六堂中习。太设施齐全，有馔堂（餐厅）、厨房、库房、浴所，有监生的集体宿舍，叫“号房”。带属的监生在外边居住，每月给定额白米生活费。
清代国子监生员有满、蒙、回、汉等族生，有朝鲜、暹罗（今泰国）、安南（今越南）、俄罗斯、日本琉球的留生。在监生员有一万人。琉球曾先派遣8批共30名留生，国子监习。清琉球生更优待，设“琉球馆”，供应他每人每日鸡1，2斤，茶5钱，豆腐1斤，椒、酱、油、菜具备。乾隆朝又给每位留生增加黄酒1瓶、菜1斤、盐1两、油2两。春秋锦缎袍褂，纺丝绸、靴袜、凉帽各一；夏赐纱袍褂、罗衫裤各一；冬季赐缎面细羊皮袍、棉袄棉裤各一，貂皮帽、鹿皮鞋、绒袜、被褥、席枕俱全；文房品每月给银一两五钱，人人有份。
国子监太门内，有琉璃牌楼，牌楼北就是辟雍。
辟雍国子监全部建筑的中是辟雍。辟雍是一座方殿，面阔16.96米。乾隆四十九年（1784年）修建，高22.44米，屋檐四角攒尖顶，盖黄色琉璃瓦，最高端铜胎鎏金宝顶，高32米。它坐落在圆形水池中央，四面有四座石桥，白石护栏围饰，就构了圆方、辟雍环水的建筑格局。什叫辟雍呢？环形碧水，古玉璧，故“辟雍”。辟雍一座高谐、雍容华贵的仿周代形制的礼制建筑。雍正、乾隆帝国子监讲，讲坛就设在辟雍。
乾隆五十年（1785年）春，75岁高龄的乾隆帝在辟雍举行盛的“临雍讲”典礼。他讲的内容是《》中的名言：“人君，止仁；人臣，止敬；人子，止孝；人父，止慈；与国人，止信。”王公臣，国子监师生，跪着听，仅听讲生就有3088人，再加各级官员、朝鲜使臣等，总数不四五千人。那有麦克风，通“传胪”官员，层层传声。讲国子监师生贤街跪送。
辟雍东西两侧各有檐廊周房33间，每11间一堂，设置东、西六堂。东率、修、广业三堂，西诚、正义、崇志三堂，是国子监分班肄业的场所。晚间晚习，“传柝三更静，挑灯六馆明”，是生苦读经书的真实写照。
彝伦堂悬挂康熙帝御书“彝伦堂”匾。彝伦堂具有朝参、临雍、讲等：清朝国子监“堂期”逢一、六日（十六日改十五日）向祭酒司业行朝参礼仪。在辟雍兴建前，皇帝临彝伦堂执经进讲。新科进士在庙行释褐（hè）礼释褐礼：新科进士一甲三名已受职、服顶戴、挂朝珠，率二、三甲均常服的进士，先谒孔庙行释菜礼，再向国子监祭酒行布衣换官服的释褐礼，始士。（《国子监志》卷二十九），“始士”（才始士）。
国子监官员品级不高。清国子监祭酒（校长）满、汉各一人（从四品），司业（副校长）满、汉、蒙各一人（正六品），博士（相教授）二人（从七品），助教若干人，有其他教与管理人员。国子监官员虽官品不高，但国师的人品与品，至今，令人尊敬。