世界的征服者吉思汗，在他六十六岁那年，死在远征西夏的战场。此，蒙古帝国虽因惯继续保持着扩张的势头，但汗诸子孙间的不已经帝国的隐患。公元一二五九年，拖雷系的蒙哥汗，非常偶在攻打南宋塞钓鱼城受伤死，他是最一蒙古帝国各部所公认的汗。
蒙哥死，其弟忽必烈在围攻南宋长江防线的重镇鄂州，旭烈兀在中东与埃及的马木留克王朝苦战，有幼弟阿不哥尚在蒙古本部。论情理，本由忽必烈继承汗位，忽必烈在蒙古本土外的平召库台（Kuriltai），封蒙古汗，但，一则部在蒙古境内。但蒙古诸亲贵一则畏忌其雄才略，二则他所鼓吹的汉化不满，遂行召库台，拥立阿不哥蒙古汗。忽必烈回师争夺汗位，双方战四年，最终阿不哥战败投降，支持阿不哥的钦察汗国察合台汗国诸王此不予承认，二任汗窝阔台的孙子海等人相继动叛乱，蒙古内讧方兴未艾。勉强夺汗位的忽必烈，放弃了中、西亚诸汗国的控制权，一经营富庶的中原，并亲王镇漠北，抵御侵扰。一二七一年，忽必烈改国号“蒙古”“元”，称己中原的皇帝，是元世祖。标志着蒙古帝国的崩溃。
占据中原的忽必烈，继续着蒙古代的侵略扩张政策。一二五九年，他迫使高丽屈服，进东窥日本。此，忽必烈曾先六次致书日本，求其称臣纳贡。日本受汉文化熏陶颇深，向师中国正统王朝，灭亡南宋的元朝有着的敌意，加南宋灭亡，批遗民逃往日本，他宣扬灭国恨，日本的民族情绪造了影响。因此镰仓幕府“未曾闻蒙古国名”拒绝臣服元朝，待忽必烈使节相的不友。
忽必烈怒，一二七四年一二八一年两次入侵日本，但均遭失败。二次远征日本战中，蒙古舰队遭飓风袭击，几乎全军覆——因场飓风挽救了日本，故被日本人称“神风”。在战死的日本武士的追悼，日本临济禅奠基者，佛光派始祖无祖元亲法。在此前，老尚给因蒙古袭情沉重的镰仓幕府掌门人北条宗写纸条，劝他“莫烦恼”。，位忠耿耿的老尚却不是日本人，他被称做“渡僧”，就是“外国的尚”，他原是中国雁荡山仁寺的高僧。无祖元虽帮助日本人，并有人说他是“汉奸”。
世祖通汉语，积极改革蒙古旧制，重汉人，但晚年却颇悔。世祖，入继统的皇帝，漠北镇王身，些镇王久居漠北，深受胡族文化的熏陶，不汉语，更顽固拒绝汉化，因此元王朝始终不融入正统中原文化中。
王朝因其激烈的民族矛盾社矛盾，迅速走向衰落，存在了不百年的间。今，曾经强的王朝，仅在北京城留几段荒颓的土墙，叫做“元遗址”。